Музей Железнодорожного района, Музей на набережной и Музей Центрального района работают в среду с 11:00 до 20:00, четверг-суббота — с 10:00 до 19:00, воскресенье — с 10:00 до 18:00.

Музей «Заельцовка» работает в среду, пятницу, субботу с 10:00 до 19:00, четверг — с 11:00 до 20:00, воскресенье — с 10:00 до 18:00.

Остальные филиалы Музея Новосибирска (Музей Октябрьского района, Музей Дзержинского района, Музей Первомайского района, Музей Советского района, Музей Калининского района, Музей «Контора инженера Г.М. Будагова») работают по следующему графику: вторник-пятница с 10:00 до 19:00, среда — с 11:00 до 20:00, суббота — с 10:00 до 18:00.

Понедельник — выходной день для всех филиалов